La nature de ramification hiérarchique des réseaux fluviaux peut avoir une forte influence sur l’assemblage des communautés d’eau douce. Cette structure unique a stimulé le développement de l'hypothèse de position du réseau (NPH), qui stipule que la force des différents processus d'assemblage dépend de la position de la communauté dans le réseau fluvial. Plus précisément, il prédit que 1) les communautés d'amont devraient être exclusivement contrôlées par l'environnement local, car elles sont plus isolées et plus hétérogènes du point de vue environnemental que les zones en aval. En revanche, 2) les communautés en aval devraient être régulées à la fois par des processus environnementaux et par des processus de dispersion en raison d’une connectivité accrue, en raison de leur position centrale dans le paysage fluvial.